Церква Преображення Господнього постала на місці церкви Пресвятої Трійці отців Тринітаріїв
Наприкінці XVIII ст. за розпорядженням цісаря Йосифа ІІ в колишньому
монастирі відкрили університет. У 1848 р. під час революційних подій
будівлі університету були зруйновані артилерійським вогнем та пожежею. Згодом імператор Франц Йосиф І подарував їх «своїм вірним русинам». На основі збережених мурів почалось спорудження другої (після Успенської) греко-католицької церкви в місті.
Будівництво тривало двадцять років (1878-1898). Проект храму в стилі історизм був розроблений Сильвестром Гавришкевичем.
Над оздобленням храму працювали митці Леонардо Марконі, котрий
створив 12 скульптур апостолів та декоративні прикраси і Тадей Попель, котрий створив образи до іконостасу.
29 квітня 1906 року церкву було освячено митрополитом Андреєм
Шептицьким.
Після років репресій та перебування в підпіллі Преображенська церква першою у Львові повернулася до УГКЦ: 29 жовтня 1989.